Kolekcja jest owocem działalności kombatantów-byłych żołnierzy Armii Krajowej, którzy w l. 90. ubiegłego wieku zaczęli pozyskiwać i gromadzić archiwalia i pamiątki związane z osobami walczącymi w Armii Krajowej oraz tematyką Polskiego Państwa Podziemnego.
W 1993 roku powołana została oficjalnie Fundacja Muzeum Historii Armii Krajowej z siedzibą na ówczesnej ulicy Bosackiej, obecnie Wita Stwosza. Członkowie Fundacji podjęli starania o utworzenie pierwszego w Polsce Muzeum Historii Armii Krajowej.
Oficjalna inauguracja Muzeum Armii Krajowej nastąpiła 27 września 2000 roku w rocznicę powstania Polskiego Państwa Podziemnego. Zbiory Fundacji Muzeum Historii Armii Krajowej zostały przekazane do Muzeum w latach 2000-2008.
Na obszerną kolekcję Fundacji o różnorodnym charakterze składają się dokumenty osobiste, legitymacje, zaświadczenia, prasa konspiracyjna, fotografie, odznaczenia, umundurowanie, uzbrojenie, sprzęt fotograficzny i łączności oraz przedmioty codziennego użytku żołnierzy Armii Krajowej.
przygotowanie informacji: Piotr Rychlik